麦胚凝集素亲和色谱富集糖肽过程中的肽键裂解

色谱 , 2009, 27(1): 19-23. doi: 10.3321/j.issn:1000-8713.2009.01.003

麦胚凝集素亲和色谱富集糖肽过程中的肽键裂解

卢庄 ^1, , 王京兰 ^2, , 贾伟 ^3, , 杨兵 ^4, , 蔡耘 ^5, , 邓玉林 ^6, , 张玉奎 ^7, , 钱小红 ^8,

基金项目: 国家重点基础研究发展规划(973计划)(2007CB914104) 国家自然科学基金(20635010;20505018)

Cleavage of amide bond during glycopeptide enrichment using wheat germ agglutinin affinity chromatography

蛋白质的糖基化是最重要的翻译后修饰之一,与蛋白质结构和功能的关系密切.凝集素亲和色谱是蛋白质糖基化研究中很常用的工具,不同的凝集素可以对不同的单糖或寡糖有特异的富集作用.麦胚凝集素(WGA)由于其特异作用的糖型广泛存在而成为使用最多的凝集素之一.在本研究中,发现将WGA用于糖肽亲和富集会导致部分肽段的降解,从而导致后续的肽段序列分析的失败.本文用4种标准蛋白质对这种现象进行了验证,结果表明肽段的降解可以发生在多个位点,其中较多地发生在酪氨酸、苯丙氨酸及亮氨酸的羧基端.这一结果提示:在糖蛋白质组研究中,如果应用WGA富集糖肽并采用质谱进行鉴定,则采用半酶切或非特异性酶切的检索策略更为合适.

参考文献

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Cleavage of amide bond during glycopeptide enrichment using wheat germ agglutinin affinity chromatography

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