模体是蛋白质二级结构上的一种特征序列,激酶底物通常具有一类特征性的模体,识别底物模体对鉴定激酶底物具有重要意义.为了快速鉴定激酶底物模体,将全细胞蛋白质酶解液作为肽段文库的来源,采用碱性磷酸酶去除肽段的固有磷酸化后构建了用于筛选激酶底物模体的肽段文库.该肽段文库是大最非磷酸化肽段的混合物,将此混合肽段与酪蛋白激酶2和 三磷酸腺苷作用30 min后,通过固定化金属离子亲和色谱法富集磷酸化肽段,采用反相液相色谱-串联质谱分析,成功地鉴定到472条非冗余底物肽段,包含451个非冗余磷酸化位点,并山此得到底物模体S/T-D/E-x-D/E.该法能够快速准确地筛选出激酶底物模体,对研究激酶-底物识别以及信号转导过程具有重要意义.
参考文献
| [1] | Ubersax J A,Ferrell J E Jr.Nat Rev Mol Cell Biol,2007,8(7):530 |
| [2] | Knighton D R,Zheng J H,Ten Eyck L F,et al.Science,1991,253(5018):407 |
| [3] | Manning G,Whyte D B,Martinez R,et al.Science,2002,298(5600):1912 |
| [4] | Johnson S A,Hunter T.Nat Methods,2005,2 (1):17 |
| [5] | Songyang Z,Blechner S,Hoagland N,et al.Curt Biol,1994,4(11):973 |
| [6] | Hutti J E,Jarrell E T,Chang J D,et al.Nat Methods,2004,1(1):27 |
| [7] | Song C,Ye M,Han G,et al.Anal Chem,2010,82(1):53 |
| [8] | Morandell S,Stasyk T,Grosstessner-Hain K,et al.Proteomics,2006,6(14):4047 |
| [9] | Beausoleil S A,Jedrychowski M,Schwartz D,et al.Proc Natl Acad Sci USA,2004,101(33):12130 |
| [10] | Villen J,Gygi S P.Nat Protoc,2008,3(10):1630 |
| [11] | Yu Z,Han G,Sun S,et al.Anal Chim Acta,2009,636(1):34 |
| [12] | Kislinger T,Rahman K,Radulovic D,et al.Mol Cell Proteomics,2003,2 (2):96 |
| [13] | Jiang X,Han G,Feng S,et al.J Proteome Res,2008,7(4):1640 |
| [14] | Crooks G E,Hon G,Chandonia J M,et al.Genome Res,2004,14(6):1188 |
| [15] | Salvi M,Satno S,Cesaro L,et al.Biochim Biophys Acta,2009,1793(5):847 |
| [16] | Schwartz D,Gygi S P.Nat Biotechnol,2005,23(11):1391 |
| [17] | Meggio F,Pinna L A.FASEB J,2003,17(3):349 |
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