针对人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞系的磷酸化膜蛋白质组,发展了基于多酶酶解法结合杂化硅胶基质固定化钛离子亲和色谱( Ti4+ -IMAC)整体柱富集的分析策略.该方法通过对细胞裂解液进行超速离心,以及1 mol/LNaC1和0.1 mol/L Na2CO3顺序清洗,获得膜蛋白质组分.所提取的蛋白质分别经胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和胃蛋白酶平行酶解,产生的肽段经Ti4+ -IMAC整体柱选择性富集磷酸肽后,采用纳升级反相液相色谱分离和质谱鉴定,成功鉴定到43个磷酸化蛋白质,其中有14个定位于膜上.研究结果表明,采用该策略开展SH- SY5Y细胞系磷酸化膜蛋白质组学分析有望加速对该肿瘤的研究和相关潜在标记物的筛选.
参考文献
[1] | Garcia J,Faca V,Jarzembowski J,et al.J Proteome Res,2009,8(8):3791 |
[2] | Hsu W M,Lee H,Juan H F,et al.Clin CancerRes,2008,14(19):6237 |
[3] | Shin B K,Wang H,Yim A M,et al.J Biol Chem,2003,278(9):7607 |
[4] | Zhang Y,Qin H Q,Wu R A,et al.Chinese Journal of Chromatography(张宇,秦洪强,吴仁安,等.色谱),2010,28(2):123 |
[5] | Haque N,Gong C X,Sengupta A,et al.Brain Res Mol Brain Res,2004,129(1/2):163 |
[6] | Blonder J,Goshe M B,Moore R J,et al.J Proteome Res,2002,1(4):351 |
[7] | Ye X Y,Johann D Jr,Hakami R M,et al.J Proteomics,2009,73(1):112 |
[8] | Hou C Y,Ma J F,Tao D Y,et al.J Proteome Res,2010,9(8):4093 |
[9] | Bhatia V N,Perlman D H,Costello C E,et al.Anal Chem,2009,81(23):9819 |
[10] | Tanaka T,Iqbal K,Trenkner E,et al.FEBS Lett,1995,360(1):5 |
[11] | Garcia-Perez J,Avila J,Diaz-Nido J,et al.J Neurosci Res,1998,52(4):445 |
[12] | Sanchez S,Sayas C L,Lim F,et al.J Neurochem,2001,78(3):468 |
[13] | de la Monte S M,Chen G J,Rivera E,et al.Cell Mol Life Sci,2003,60 (12):2679 |
[14] | Lee S Y,Kim J W,Jeong M H,et al.FEBS Lett,2008,582(19):2826 |
[15] | Kumar H R,Zhong X L,Hoelz D J,et al.Pediatr Surg Int,2008,24(11):1229 |
[16] | Okada H,Zhang W,Peterhoff C,et al.Faseb J,2010,24(8):2783 |
[17] | Tomonaga T,Levens D.J Biol Chem,1995,270(9):4875 |
[18] | Michelotti E F,Michelotti G A,Aronsohn A I,et al.Mol Cell Biol,1996,16(5):2350 |
[19] | Choi H S,Song K Y,Hwang C K,et al.Mol Cell Proteomics,2008,7(8):1517 |
[20] | Beaudry H,Gendron L,Guimond M O,et al.Endocrinology,2006,147(9):4263 |
上一张
下一张
上一张
下一张
计量
- 下载量()
- 访问量()
文章评分
- 您的评分:
-
10%
-
20%
-
30%
-
40%
-
50%