分泌蛋白质组(secretome)是指在特定的时空条件下,细胞、组织等分泌的全部蛋白质.分泌蛋白质组可能包含了大量的疾病诊断生物标志物,因此其相关研究越来越受到重视.分泌蛋白质组的组成高度复杂且浓度范围宽,这对分析方法提出了挑战.建立有效的蛋白质或肽段预分离策略,将有利于分泌蛋白质的高覆盖率鉴定.本研究以肝癌细胞系MHCC97L的无血清培养分泌蛋白质为研究对象,采用一种新型等电聚焦预分离(OFFGEL)系统,考察了肽段水平的分级对蛋白质鉴定结果的影响.结果表明,分离后各馏分中肽段的等电点分布与理论预测基本一致,每个馏分中单独鉴定的肽段比例接近80％,显示了该系统对肽段的高分辨分离能力结合生物质谱技术,在肝癌细胞分泌系统中鉴定了 2995个蛋门质,显示了该系统在复杂体系蛋白质组研究中的应用潜力.
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