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组蛋白翻译后修饰无标定量方法可靠性的比较

刘志伟 , 朱明睿 , 翟琳辉 , 谭敏佳

色谱 doi:10.3724/SP.J.1123.2016.04040

组蛋白翻译后修饰是一种表观遗传学修饰,参与调控细胞的新陈代谢等重要生理过程.蛋白质组学发展迅速,使监控组蛋白翻译后修饰的动态变化成为可能.目前主要有3种无标定量方法(谱图计数法、峰面积积分法和信号强度法),但何种定量方法更可靠尚未见系统性的详细报道.在稳定同位素标记细胞培养技术(SILAC)基础上,对去乙酰化酶抑制剂(SAHA)调控细胞乙酰化修饰水平的定量数据进行对比,比较3种无标定量方法对组蛋白翻译后修饰进行的定量分析,利用定量结果的标准差(SD)评估定量的可靠性,最终发现基于峰面积积分法定量的结果可靠性最高.该研究对难以进行同位素标记实验的样本分析,尤其对临床样本、大样本的组蛋白修饰谱分析具有重要参考意义.

关键词: 组蛋白翻译后修饰 , 无标定量 , 可靠性

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