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电离辐射改变长链非编码RNA的表达谱

李朋飞 , 胡文涛 , 裴海龙 , 丁楠 , 周光明

原子核物理评论 doi:10.11804/NuclPhysRev.32.04.484

长链非编码RNA(lncRNA)是长度超过200 nt、不具有蛋白编码功能的转录本,它们在真核生物中发挥基因调控等重要作用。迄今为止,还没有检索到有关参与电离辐射应答的lncRNA研究报道。据推测,细胞暴露于电离辐射之后有些lncRNA的转录水平将发生变化。因此,采用2 Gy的X射线辐照HeLa细胞,辐照后4 h提取总RNA进行全序列测序。最终发现1028种lncRNA的转录水平发生了改变,其中包括381种新lncRNA。从中随机挑选24种lncRNA,用实时荧光定量PCR法验证了2 Gy的X射线或80 keV/μm碳离子束照射后的表达变化,发现其变化趋势和测序结果一致。此研究为电离辐射应答相关lncRNA的功能研究奠定了基础。

关键词: 长链非编码RNA , 电离辐射 , RNA测序 , 实时荧光定量PCR

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