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液相色谱-质谱法比较分析正常人与胃癌患者的胃组织蛋白质

罗福文 , 陶定银 , 赵鹏 , 张凌怡 , 贾玉杰 , 张维冰

色谱 doi:10.3724/SP.J.1123.2010.00034

通过蛋白质组学技术筛选胃癌相关标志物是目前胃癌研究的热点,也是早期诊断的关键.针对组织蛋白质提取物非常复杂的特点,并根据疏水性的差异,采用反相液相色谱对正常及癌症组织提取蛋白质进行分离.通过比较正常及癌症组织提取蛋白质的谱图差异,收集并酶解差异最大的保留时间为45~47 min的馏分,采用液相色谱-多级质谱联用(LC-MS/MS)鉴定其酶解产物.鉴定结果显示,正常及癌症组织中的共有蛋白质为9个,正常组织中有6个特异蛋白质,而癌症组织中有17个特异蛋白质.通过进一步分析,筛选出胃癌组织中含有的丰度较高的两个蛋白质.应用生物信息学方法分析这些蛋白质,能为将来的药物靶点、药物作用通路研究提供更多的信息.

关键词: 液相色谱-多级质谱法 , 特异蛋白质 , 癌症 , 胃组织

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