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毛细管电泳法评价细胞色素c与单链脱氧核糖核酸库的相互作用

梅芳 , 赵新颖 , 屈锋

色谱 doi:10.3724/SP.J.1123.2012.09033

以细胞色素c(Cyt c)为碱性蛋白质模型,建立了毛细管电泳评价Cyt c与3种不同链长的单链脱氧核糖核酸(ssDNA)库相互作用的评价方法,研究了离子强度对Cyt c与ssDNA库相互作用的影响.比较了Cyt c与含有20、40和60个随机碱基序列的3种不同链长的ssDNA库的作用及基于未涂层毛细管和涂层毛细管的毛细管区带电泳方法.因碱性蛋白质在未涂层毛细管管壁上存在吸附,因此利用未涂层毛细管区带电泳不能区别3种ssDNA库与其作用的差异.利用涂层毛细管电泳法,在压力辅助的反向电压下,根据游离ssDNA库的峰面积变化可比较3种ssDNA库与细胞色素c的相互作用差异.结果表明,含有20个随机寡核苷酸链长的ssDNA库与Cty c的作用最强.此外,NaC1浓度显著影响Cyt c与ssDNA60库的作用.在优化的实验条件下,0.02 mol/L NaC1有利于两者的相互作用.调节盐浓度可抑制非特异性静电作用,能提高碱性蛋白质适配体的单轮筛选效率.利用未涂层毛细管电泳分析复合物及游离ssDNA库的峰面积变化,可优化有利复合物形成的盐浓度.

关键词: 毛细管电泳 , 细胞色素c , 单链DNA库 , 碱性蛋白质 , 核酸适配体

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