王灼维
,
彭福利
,
王媛
,
童维
,
任艳
,
徐宁志
,
刘斯奇
色谱
膜蛋白质在变性剂作用下能够较充分地溶解.根据这一特点,我们试图在变性剂溶液中采用串联离子交换色谱法分离小鼠肝脏膜蛋白质.将小鼠肝脏膜蛋白质溶解于含有4 mol/L 尿素,20 mmol/L 三羟甲基氨基甲烷(Tris)-盐酸缓冲液(pH 9.0)中,用Q-Sepharose FF和Sephacryl S-200HR树脂组成的色谱柱结合大部分溶解的膜蛋白质,然后采用氯化钠线性梯度洗脱蛋白质,分步收集后采用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)进一步分离洗脱组分的蛋白质.利用胶内胰蛋白酶消化技术将SDS-PAGE胶内分离的蛋白质降解为相应的肽段,然后以反相高效液相色谱分离和离子阱质谱仪鉴定肽段.根据文献报道和蛋白质的功能分类,在所鉴定的392个蛋白质中有306个可能为膜蛋白质或膜结合蛋白质.蛋白质的疏水性计算表明,GRAVY(grand average of hydropathicity)得分大于或等于0.00的蛋白质有83个.综上所述,我们有理由认为本实验方法基本符合小鼠肝脏膜蛋白质组学研究的要求.
关键词:
多维离子交换色谱
,
十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳
,
反相高效液相色谱
,
串联质谱
,
膜蛋白质
,
小鼠肝脏
侯春彦
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马俊锋
,
陶定银
,
张丽华
,
梁振
,
张玉奎
色谱
doi:10.3724/SP.J.1123.2011.00851
针对人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞系的磷酸化膜蛋白质组,发展了基于多酶酶解法结合杂化硅胶基质固定化钛离子亲和色谱( Ti4+ -IMAC)整体柱富集的分析策略.该方法通过对细胞裂解液进行超速离心,以及1 mol/LNaC1和0.1 mol/L Na2CO3顺序清洗,获得膜蛋白质组分.所提取的蛋白质分别经胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和胃蛋白酶平行酶解,产生的肽段经Ti4+ -IMAC整体柱选择性富集磷酸肽后,采用纳升级反相液相色谱分离和质谱鉴定,成功鉴定到43个磷酸化蛋白质,其中有14个定位于膜上.研究结果表明,采用该策略开展SH- SY5Y细胞系磷酸化膜蛋白质组学分析有望加速对该肿瘤的研究和相关潜在标记物的筛选.
关键词:
人神经母细胞瘤
,
磷酸化肽富集
,
膜蛋白质
,
多酶酶解
,
固定化钛离子亲和色谱
,
有机-无机杂化硅胶整体材料
