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二氧化钛富集磷酸肽方法优化及在腾冲嗜热厌氧菌磷酸化蛋白质组分析中的应用

林威 , 王京兰 , 应万涛 , 钱小红

色谱 doi:10.3724/SP.J.1123.2012.04027

为了提高二氧化钛富集磷酸肽法对磷酸肽的富集效率,以6种标准蛋白酶切肽段混合物为研究对象,对二氧化钛富集磷酸肽过程中的乙腈比例、三氟乙酸比例、二氧化钛用量等条件分别进行了优化.结果表明在乙腈含量为80% (v/v),三氟乙酸含量为1%(v/v),二氧化钛用量与需要富集肽段的质量比为40∶1的条件下,可以取得较好的富集效果.将优化后的富集方法应用于腾冲嗜热厌氧菌磷酸化蛋白质的分析,初步鉴定到25个磷酸化蛋白质,为进一步研究这种极端环境下生存的低等生物的生命活动提供了参考信息.

关键词: 液相色谱 , 质谱 , 二氧化钛 , 磷酸肽 , 富集 , 腾冲嗜热厌氧菌 , 蛋白质组

镧对肝细胞株7701的增殖和对蛋白质表达的影响

刘会雪 , 杨晓达 , 王夔

中国稀土学报

采用MTT法考察了La3+在2×10-4~4×10-7 mol·L-1浓度范围内对体外培养的人正常肝细胞株7701的生长和增殖的影响及其对浓度的依赖关系.结果表明,低浓度的La3+对细胞有明显的促增殖作用,而高浓度的La3+对细胞的生长表现抑制作用.为探讨促增殖的细胞是否正常,利用双向凝胶电泳技术,对La3+诱导增殖的细胞和对照组正常细胞进行蛋白质分离和分析,发现两组细胞蛋白质的表达存在着明显的差异,表示在稀土促进增殖下的细胞可能并非正常,并讨论了La3+促进细胞增殖的可能机制及其过程.

关键词: 稀土生物效应 , 增殖 , 蛋白质组 , 双向凝胶电泳 , 稀土

钆对费氏中华根瘤菌抑制效应的蛋白质组分析

韩威威 , 沈世华 , 台培东

中国稀土学报

运用双向凝胶电泳和MALDI-TOF质谱技术,分析了Gd3+对费氏中华根瘤菌USDA 205的抑制效应.结果表明,经1 mmol·L-1 Gd3+处理12 h后,22个蛋白质表达量有显著变化,其中13个蛋白质表达量增加,9个蛋白质表达量下降.这些蛋白质可根据功能分为8类,包括转运蛋白、胁迫相关蛋白、代谢相关蛋白等.

关键词: 费氏中华根瘤菌 , , 蛋白质组 , 稀土元素

蛋白质组研究中的二维电泳分离技术

李蕾 , 应万涛 , 杨何义 , 蔡耘 , 钱小红

色谱 doi:10.3321/j.issn:1000-8713.2003.01.007

对目前生命科学研究中的热点领域蛋白质组研究中应用的主要分离技术二维聚丙烯酰胺凝胶电泳的基本原理、应用和最新进展进行了综述.同时,针对二维凝胶电泳的缺陷,介绍了目前正在发展的几种替代技术.

关键词: 蛋白质组 , 二维凝胶电泳 , 等电聚焦 , 胶上差示电泳

鼠肝蛋白质组的纳升级多维液相色谱分离

王彦 , 高明霞 , 谷雪 , 张祥民

色谱 doi:10.3321/j.issn:1000-8713.2005.01.009

搭建了一个纳升级的二维液相色谱分离平台(nano-2D-LC),该平台可以自动完成进样、除盐、分离及鉴定.以离子交换色谱(SCX)为第一维,反相液相色谱(RPLC)为第二维,对鼠肝组织的蛋白质组进行了研究.SCX采用阶梯式洗脱,RPLC运用线性梯度洗脱,以200 nL/min的速度进行分离,峰容量可达620.

关键词: 蛋白质组 , 多维液相色谱 , 鼠肝 , 纳升级

基于共价色谱分离的含半胱氨酸肽段富集策略

米薇 , 王晶 , 应万涛 , 贾伟 , 蔡耘 , 钱小红

色谱

多维色谱分离、串联质谱分析技术已在蛋白质组研究中得到广泛应用.然而生物样品的蛋白质以及全酶切肽段具有高度的复杂性,这严重干扰了蛋白质高通量、规模化的分析.通过标签肽段富集进行样品预分离可以降低体系的复杂程度.本文建立了一种基于共价色谱技术选择性分离富集含半胱氨酸肽的方法,从而降低了样品体系的复杂程度.首先以牛血清白蛋白(BSA)的酶切肽段为模型,对富集条件进行了优化和考察,并在此基础上通过5种蛋白质酶切肽段混合物的富集对该方法进行了验证.结果证明此方法的重现性好,富集效率高,富集特异性好,能有效地富集鉴定含半胱氨酸肽段.所建立的方法在复杂体系的蛋白质组研究中具有广泛的应用前景,为复杂样品的蛋白质高通量、自动化、规模化鉴定和定量研究提供了实用技术.

关键词: 共价色谱 , 液相色谱-串联质谱 , 含半胱氨酸肽 , 富集 , 蛋白质组

基于在线二维色谱的不同生长时期鹿茸的比较蛋白质组分析

高亮 , 乔晓强 , 梁振 , 张丽华 , 霍玉书 , 张玉奎

色谱

建立了基于在线二维弱阴离子交换色谱-反相液相色谱(2D-WAX-RPLC)的蛋白质分离系统,并用于不同生长时期鹿茸的比较蛋白质组分析.以5种标准蛋白质的混合物为样品,考察了系统的重现性.通过改变标准蛋白质之间的浓度比,研究了该系统进行蛋白质相对定量的能力.在此基础上,针对4个不同生长时期的鹿茸样品,分别采用5种不同的方法进行蛋白质提取,经2D-WAX-RPLC分离后,收集各生长时期对应蛋白质的峰高最大比超过2的组分.酶解后,采用微柱反相液相色谱-串联质谱(μRPLC-MS/MS)进行肽段的分离鉴定;共从9个差异蛋白质峰中鉴定到了22个差异蛋白质.研究结果表明,利用基于蛋白质水平的在线二维液相色谱分离技术找寻差异蛋白质,具有重现性好、自动化程度高等优点,可用于开展比较蛋白质组学的研究.

关键词: 在线二维液相色谱 , 鹿茸 , 蛋白质组 , 不同生长时期 , 比较蛋白质组

选择性反应监测技术在蛋白质组学研究中的进展及应用

单亦初 , 张丽华 , 张玉奎

色谱 doi:10.3724/SP.J.1123.2013.12019

选择性反应监测(SRM)技术作为一种重要的定向蛋白质分析技术,通过选择性检测特定母离子和子离子来排除非目标组分的干扰,增强了检测灵敏度和定量准确度,具有选择性高、重复性好、灵敏度高、动态范围宽等优点,已被广泛应用于定量蛋白质组学研究,在生命科学领域发挥着至关重要的作用。本文从分析通量、检测灵敏度、定量方法以及相关软件资源4个方面,对近期 SRM 技术的研究进展进行了综述。然后,对 SRM 技术在蛋白质组学研究包括生物标志物验证、蛋白质翻译后修饰研究、生物工程以及信号通路分析等领域中的应用进行了概述。最后,本文对 SRM 技术的应用以及发展前景进行了展望。

关键词: 选择性反应监测 , 蛋白质组 , 定量 , 综述

重离子辐照对人肝癌HepG2细胞蛋白质组图谱的影响

吴庆丰 , 李强 , 金晓东

原子核物理评论

分别制备经1 Gy C离子辐照和未经辐照人肝癌HepG2细胞的总蛋白样品, 采用固相pH梯度双向凝胶电泳技术进行蛋白分离, 用ImageMaster 2D双向电泳凝胶图像分析软件分析数字化图谱. 结果显示, 差异表达的蛋白质点为17个, 其中1个仅在未经C离子辐照的HepG2细胞中表达, 8个蛋白质点在辐照后的细胞中表达上调, 8个蛋白质点在辐照后的细胞中表达下调. 建立了重复性较好和分辨率较高的分离HepG2细胞总蛋白的双向电泳技术. 实验结果表明, C离子辐照HepG2细胞后其蛋白质组发生了改变.

关键词: HepG2人肝癌细胞 , 重离子辐照 , 蛋白质组 , 双向凝胶电泳

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