毛心丽
,
卫军营
,
牛明
,
周廉淇
,
王雪颖
,
佟巍
,
秦伟捷
,
张养军
,
钱小红
色谱
doi:10.3724/SP.J.1123.2011.11020
建立了依赖色谱保留时间的智能化选择反应监测质谱方法,并与非依赖色谱保留时间的智能化选择反应监测质谱分析方法对不同体系(牛血清白蛋白酶切物、6种标准蛋白质混合物酶切物、腾冲嗜热菌蛋白提取液酶切物)的分析结果进行了系统比较.结果表明,引入色谱保留时间后的智能化选择反应监测质谱方法能够显著提高肽段及蛋白质的鉴定量,并且在复杂体系(如腾冲嗜热菌蛋白提取液酶切物)中效果尤为明显,鉴定到的肽段及蛋白质的覆盖率可分别达到目标肽段和蛋白质数量的89.62％和92.41％,并且灵敏度高、重复性好,能够实现对质荷比相同但保留时间有差异的肽段的准确鉴定.该方法将在复杂生物样本目标蛋白质组高通量、高灵敏度的鉴定、验证和确认中发挥独特作用.
关键词:
液相色谱
,
保留时间
,
智能化选择反应监测
,
质谱
,
目标蛋白质组学
,
腾冲嗜热菌
张养军
,
张万军
,
马岩
,
彭博
,
钱小红
色谱
doi:10.3321/j.issn:1000-8713.2009.05.004
蛋白质组学研究的核心技术之一是分离分析方法.该综述重点评述了分离分析技术在蛋白质组学研究,即在蛋白质组表达谱构建、翻译后修饰蛋白质组研究、蛋白质复合体和相互作用研究、蛋白质组定量研究中应用的新进展,介绍了各种分离分析方法的优点、应用范围和有待解决的问题.引用文献89篇.
关键词:
蛋白质组学
,
分离技术
,
质谱
,
定量技术
,
蛋白质相互作用
梁玉
,
张丽华
,
张玉奎
色谱
doi:10.3724/SP.J.1123.2011.00805
蛋白质组学是后基因时代生命科学研究的核心内容之一,其中发展高分辨、高灵敏度、高准确性和高通量的分析技术至关重要.整体材料具有制备简单、传质速度快、色谱柱反压低、表面易修饰等优点,因此已被广泛用于蛋白质组学研究中.本文对各种整体材料(包括有机聚合物整体材料、硅胶整体材料、有机-无机杂化整体材料)的制备方法及其在蛋白质组学研究(如蛋白质的酶解、蛋白质和肽段的分离以及在线酶解-分离-鉴定的高通量分析)中的应用进行了系统综述.
关键词:
整体材料
,
制备
,
应用
,
蛋白质组学
,
综述
那宏坤
,
黄清育
,
陈盈盈
,
黄河清
色谱
doi:10.3321/j.issn:1000-8713.2008.06.003
以甲基对硫磷(MP)为有机磷农药污染源,采用蛋白质组学技术分离及鉴定在甲基对硫磷胁迫下,牙鲆(Paralichthys olivaceus)脑组织表达的差异蛋白质,从中筛选出潜在的适合于监测甲基对硫磷污染程度的蛋白指示物.实验结果表明:在甲基对硫磷胁迫下,牙鲆脑组织表达出17个差异蛋白质,经肽质量指纹(PMF)图谱技术鉴定后,发现其中部分差异蛋白质为热休克蛋白、细胞色素P450和谷胱甘肽S-转移酶,均是与受甲基对硫磷胁迫有关的蛋白质.
关键词:
蛋白质组学
,
双向电泳
,
甲基对硫磷
,
蛋白指示物
,
牙鲆脑
吕晓迎
,
瞿颖华
,
杨雅敏
,
黄炎
功能材料
应用蛋白质组学结合生物信息学方法研究纳米金与人皮肤成纤维细胞(HDF-f )的作用机理.首先采用柠檬酸钠还原氛金酸法制备20nm的纳米金,然后应用MTT法和流式细胞术评价纳米金的细胞毒性及对细胞周期和细胞凋亡的影响.接着应用蛋白质组学技术和生物信息学方法筛选纳米金作用后细胞发生差异表达的蛋白质并进行基因本体论分析.MTT实验结果表明,浓度为200μmo1/L,粒径为20nm的纳米金与HDF-f作用1,4,8h后均未产生细胞毒性,流式细胞仪结果显示纳米金作用后S期细胞增加而G2/M期细胞减少.对蛋白质组学实验筛选出的29个功能蛋白质进行的基因本体论分析表明,纳米金可能会影响细胞RNA转录过程及能量代谢调节,诱导细胞产生免疫响应,进而对细胞的生理过程产生影响.
关键词:
纳米金
,
蛋白质组学
,
生物信息学
,
GO分析
,
分子生物相容性
单亦初
,
张丽华
,
张玉奎
色谱
doi:10.3724/SP.J.1123.2013.12019
选择性反应监测（SRM）技术作为一种重要的定向蛋白质分析技术，通过选择性检测特定母离子和子离子来排除非目标组分的干扰，增强了检测灵敏度和定量准确度，具有选择性高、重复性好、灵敏度高、动态范围宽等优点，已被广泛应用于定量蛋白质组学研究，在生命科学领域发挥着至关重要的作用。本文从分析通量、检测灵敏度、定量方法以及相关软件资源4个方面，对近期 SRM 技术的研究进展进行了综述。然后，对 SRM 技术在蛋白质组学研究包括生物标志物验证、蛋白质翻译后修饰研究、生物工程以及信号通路分析等领域中的应用进行了概述。最后，本文对 SRM 技术的应用以及发展前景进行了展望。
关键词:
选择性反应监测
,
蛋白质组
,
定量
,
综述
包慧敏
,
谢力琦
,
陆豪杰
色谱
doi:10.3724/SP.J.1123.2016.09003
蛋白质糖基化是一种广泛存在的重要的蛋白质翻译后修饰,糖基化肽在总酶解肽中占的比例不超过5％,这使得糖肽的分离富集成为糖蛋白质组学研究发展的关键技术之一.在诸多糖蛋白质组富集技术中,化学方法是富集技术的主导,本文从化学反应的角度介绍糖基化蛋白质富集的技术进展.富集过程按照连接和释放分别讨论,在连接过程中,重点介绍硼酸化学法、肼化学法、胺化学法和肟点击法;在释放过程中,以N-糖蛋白的酶释放法和O-糖蛋白的β-消除法为主导,一并介绍了最新的氧化断裂释放的化学法.最后,讨论总体富集策略的发展现状.该文以糖蛋白富集的共价反应为核心,分析不同方法的优缺点以及各技术在糖蛋白质组学研究中的应用和贡献.
关键词:
糖蛋白质组
,
蛋白质糖基化
,
糖蛋白
,
富集
,
连接/释放
,
共价反应
,
综述
周愿
,
单亦初
,
张丽华
,
张玉奎
色谱
doi:10.3724/SP.J.1123.2013.05007
定量蛋白质组学已经成为后基因时代的重要研究方向之一.目前该领域的研究主要采用无标记定量方法和稳定同位素标记定量法.其中,基于稳定同位素标记的蛋白质组定量方法发展非常迅速,已为生命科学研究提供了重要的技术支撑.本文分析了基于稳定同位素标记的蛋白质组学定量方法,包括相对定量方法和绝对定量方法,并对其发展进行了展望.
关键词:
定量蛋白质组学
,
稳定同位素标记
,
相对定量
,
绝对定量
